在河蟹养殖全过程中，要积极从生态环境角度来防止疾病的发生，促使河蟹健康生长。保持良好的生态环境，增强抗病能力，才能促进河蟹的健康生长，获得高产高效。如根据养殖的需要和水源实际情况建设相应大小的蓄水池，在蓄水池中消毒、培育水质，放养的扣蟹要在3％～4％食盐溶液中浸泡消毒10分钟。在彻底清塘的基础上，放养前半个月使用有益菌改造底质，放养前调节好水质，增施适量的肥料。
水质调控中要始终保持蟹池水体呈微碱性，适时加注新水，泼洒生石灰等有效药物进行消毒和改良水质。根据养殖中的水质具体情况，可以适时投放定量的光合细菌、芽孢杆菌以调节水质，促进河蟹摄食蜕壳，减少疾病的发生。
水质要达到“清”、“新”、“嫩”、“爽”。透明度达到35～50厘米之间，早期肥度可以适当高一些，中后期逐渐控制清爽一些。换水采取少量、勤换的方式，特别是高温季节水质变化很快，容易产生有毒的氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质。可采用光合细菌等净化水质，控制藻相，抑制致病菌，调节酸碱平衡，稳定环境。